โครงสร้างทั่วไป

โครงสร้างทั่วไปของฟังไจ
เซลล์เดี่ยวและไฮฟา (Single cell and hypha)
โครงสร้างของฟังไจแตกต่างกันไปแล้วแต่ชนิดและสภาพแวดล้อม
โครงสร้างแบบเซลล์เดี่ยว โครงสร้างแบบเป็นเส้นสาย
ฟังไจสองรูป (Dimorphic fungi)
ฟังไจบางชนิดมีรูปร่างสองแบบ กล่าวคือแบบเซลล์เดี่ยวและแบบเส้นใย ซึ่งขึ้นอยู่กับสภาพแวดล้อมในขณะนั้น
ฟังไจสองรูป ( Histoplasma capsulatum )
อมีบาและพลาสโมเดียม (Amoeba and plasmodium)
ฟังไจบางชนิด เช่น ราเมือก มีรูปร่างในระยะหาอาหารที่คล้ายอมีบาหรือพลาสโมเดียม กินอาหารโดยการโอบล้อมอาหารแล้วกินเข้าไปทั้งก้อน
อมีบา พลาสโมเดียม
ไรซอยด์ (Rhizoid)
ฟังไจในกลุ่มราขนมปังและฟังไจอื่น ๆ อีกบางชนิดสร้างเส้นใยที่มีลักษณะคล้ายรากพืชเรียกไรซอยด์ เกิดขึ้นในบริเวณที่เส้นใยสัมผัสกับอาหาร โดยส่วนของไรซอยด์จะงอกเข้าไปในวัตถุอาหาร เพื่อใช้ช่วยในการยึดเกาะและดูดซึมอาหาร
ไรซอยด์
ฮอสโตเรียม (Haustorium)
ฟังไจพาราสิตบางชนิดสร้างโครงสร้างพิเศษ เพื่อดันเยื่อเมมเบรนของเซลล์เจ้าบ้านให้ยื่นเข้าไปในเซลล์เพื่อดูดซึมอาหารจากเซลล์ของเจ้าบ้าน เรียกโครงสร้างนี้ว่าฮอสโตเรียม ( haustorium; พหูพจน์ = haustoria) ฮอสโตเรียม
ไรโซมอร์ฟ (Rhizomorph)
ไรโซมอร์ฟ ประกอบด้วยเส้นใยจำนวนมาก คาดกันว่าไรโซมอร์ฟช่วยลำเลียงอาหารและแร่ธาตุให้กับเส้นใยในดอกเห็ด ไรโซมอร์ฟ
เส้นใยของฟังไจบางชนิด เมื่อพบกับสภาพแวดล้อมที่ไม่เหมาะสม เช่น อุณหภูมิหรือความชื้นต่ำหรือสูงเกินไป จะเข้าสู่ระยะพักตัว โดยเส้นใยบริเวณนั้นจะแตกแขนงสั้น ๆ และสานกันจนกลายเป็นกลุ่มก้อนที่มีรูปร่างและลักษณะจำเพาะของแต่ละสปีชีส์ เรียกแต่ละก้อนว่า สเคลอ-โรเตียม (sclerotium; พหูพจน์ = sclerotia) สเคลอโรเตียม